Tổ chức chung

Năm 2006, thực hiện chế độ Chính ủy, Chính trị viên trong Quân đội. Theo đó Đảng bộ trong Học viện Hậu cần bao gồm:

• Đảng bộ Học viện Hậu cần là cao nhất.
• Đảng bộ các Hệ quản lý, Tiểu đoàn, Khoa thuộc Học viện Hậu cần.
• Chi bộ các Phòng, ban chức năng, các Bộ môn, các đơn vị cơ sở.

Đảng ủy Học viện Hậu cần

1. Bí thư: Chính ủy Học viện Hậu cần
2. Phó Bí thư: Giám đốc Học viện Hậu cần

Ban Thường vụ

1. Ủy viên Thường vụ: Phó Chính uỷ Học viện Hậu cần
2. Ủy viên Thường vụ: Phó Giám đốc Học viện Hậu cần
3. Ủy viên Thường vụ: Chủ nhiệm Chính trị Học viện Hậu cần

Ban Chấp hành Đảng bộ

1. Đảng ủy viên: Phó Chính ủy Học viện Hậu cần
2. Đảng ủy viên: Chủ nhiệm Chính trị
3. Đảng ủy viên: Chánh Văn phòng
4. Đảng ủy viên: Viện trưởng Viện Nghiên cứu khoa học hậu cần quân sự
5. Đảng ủy viên: Trưởng phòng Đào tạo
6. Đảng ủy viên: Trưởng ban Tài chính
7. Đảng ủy viên: Hệ trưởng Hệ Chỉ huy tham mưu hậu cần
8. Đảng ủy viên: Tiểu đoàn trưởng Tiểu đoàn 1
9. Đảng ủy viên: Hệ trưởng Hệ Quốc tế
10. Đảng ủy viên: Chủ nhiệm Khoa
11. Đảng ủy viên: Chủ nhiệm Khoa
12. Đảng ủy viên: Chủ nhiệm Khoa